spaMM (Q27765): Difference between revisions
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Swh import (talk | contribs) SWHID from Software Heritage |
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Mixed-Effect Models, with or without Spatial Random Effects | |||||||||||||||
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publication date: 22 July 2016
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publication date: 20 December 2023
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Property / CRAN project | |||||||||||||||
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20 December 2023
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Property / last update: 20 December 2023 / rank | |||||||||||||||
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Property / description | |||||||||||||||
Inference based on models with or without spatially-correlated random effects, multivariate responses, or non-Gaussian random effects (e.g., Beta). Variation in residual variance (heteroscedasticity) can itself be represented by a mixed-effect model. Both classical geostatistical models (Rousset and Ferdy 2014 <doi:10.1111/ecog.00566>), and Markov random field models on irregular grids (as considered in the 'INLA' package, <https://www.r-inla.org>), can be fitted, with distinct computational procedures exploiting the sparse matrix representations for the latter case and other autoregressive models. Laplace approximations are used for likelihood or restricted likelihood. Penalized quasi-likelihood and other variants discussed in the h-likelihood literature (Lee and Nelder 2001 <doi:10.1093/biomet/88.4.987>) are also implemented. | |||||||||||||||
Property / description: Inference based on models with or without spatially-correlated random effects, multivariate responses, or non-Gaussian random effects (e.g., Beta). Variation in residual variance (heteroscedasticity) can itself be represented by a mixed-effect model. Both classical geostatistical models (Rousset and Ferdy 2014 <doi:10.1111/ecog.00566>), and Markov random field models on irregular grids (as considered in the 'INLA' package, <https://www.r-inla.org>), can be fitted, with distinct computational procedures exploiting the sparse matrix representations for the latter case and other autoregressive models. Laplace approximations are used for likelihood or restricted likelihood. Penalized quasi-likelihood and other variants discussed in the h-likelihood literature (Lee and Nelder 2001 <doi:10.1093/biomet/88.4.987>) are also implemented. / rank | |||||||||||||||
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Property / author | |||||||||||||||
Property / author: François Rousset / rank | |||||||||||||||
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Property / author | |||||||||||||||
Property / author: Jean-Baptiste Ferdy / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / author | |||||||||||||||
Property / author: Alexandre Courtiol / rank | |||||||||||||||
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Property / copyright license | |||||||||||||||
Property / copyright license: CeCILL version 2 / rank | |||||||||||||||
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Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: methods / rank | |||||||||||||||
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Property / imports | |||||||||||||||
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Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: graphics / rank | |||||||||||||||
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Property / imports | |||||||||||||||
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Property / imports | |||||||||||||||
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Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: proxy / rank | |||||||||||||||
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Property / imports | |||||||||||||||
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Property / imports: Rcpp / qualifier | |||||||||||||||
software version identifier: ≥ 0.12.10 | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: nlme / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: nloptr / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: minqa / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: pbapply / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: crayon / rank | |||||||||||||||
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Property / imports | |||||||||||||||
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Property / imports | |||||||||||||||
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Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: geometry / rank | |||||||||||||||
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Property / imports: geometry / qualifier | |||||||||||||||
software version identifier: ≥ 0.4.0 | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
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Normal rank | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: backports / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / cites work | |||||||||||||||
Property / cites work: Testing environmental and genetic effects in the presence of spatial autocorrelation / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / cites work | |||||||||||||||
Property / cites work: Hierarchical generalised linear models: A synthesis of generalised linear models, random-effect models and structured dispersions / rank | |||||||||||||||
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Property / MaRDI profile type | |||||||||||||||
Property / MaRDI profile type: MaRDI software profile / rank | |||||||||||||||
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Property / depends on software | |||||||||||||||
Property / depends on software: R / rank | |||||||||||||||
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Property / depends on software: R / qualifier | |||||||||||||||
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Property / source code repository | |||||||||||||||
Property / source code repository: https://github.com/cran/spaMM / rank | |||||||||||||||
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Property / Software Heritage ID | |||||||||||||||
Property / Software Heritage ID: swh:1:snp:2474607e5c55750c175e5e86a092889a7753ce6e / rank | |||||||||||||||
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Property / Software Heritage ID: swh:1:snp:2474607e5c55750c175e5e86a092889a7753ce6e / qualifier | |||||||||||||||
Property / Software Heritage ID: swh:1:snp:2474607e5c55750c175e5e86a092889a7753ce6e / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 29 December 2023
| |||||||||||||||
links / mardi / name | links / mardi / name | ||||||||||||||
Latest revision as of 16:12, 21 March 2024
Mixed-Effect Models, with or without Spatial Random Effects
Language | Label | Description | Also known as |
---|---|---|---|
English | spaMM |
Mixed-Effect Models, with or without Spatial Random Effects |
Statements
20 December 2023
0 references
Inference based on models with or without spatially-correlated random effects, multivariate responses, or non-Gaussian random effects (e.g., Beta). Variation in residual variance (heteroscedasticity) can itself be represented by a mixed-effect model. Both classical geostatistical models (Rousset and Ferdy 2014 <doi:10.1111/ecog.00566>), and Markov random field models on irregular grids (as considered in the 'INLA' package, <https://www.r-inla.org>), can be fitted, with distinct computational procedures exploiting the sparse matrix representations for the latter case and other autoregressive models. Laplace approximations are used for likelihood or restricted likelihood. Penalized quasi-likelihood and other variants discussed in the h-likelihood literature (Lee and Nelder 2001 <doi:10.1093/biomet/88.4.987>) are also implemented.
0 references
Identifiers
29 December 2023
0 references