protti (Q80360): Difference between revisions
From MaRDI portal
Removed claim: author (P16): Jan-Philipp Quast (Q80288) |
Added link to MaRDI item. |
||||||||||||||
(32 intermediate revisions by 2 users not shown) | |||||||||||||||
Property / last update | |||||||||||||||
| |||||||||||||||
Property / last update: 20 January 2023 / rank | |||||||||||||||
Property / author | |||||||||||||||
Property / author: Dina Schuster / rank | |||||||||||||||
Property / copyright license | |||||||||||||||
Property / copyright license: MIT license / rank | |||||||||||||||
Property / copyright license | |||||||||||||||
Property / copyright license: File License / rank | |||||||||||||||
Property / copyright license: File License / qualifier | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: ggplot2 / rank | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: utils / rank | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: lifecycle / rank | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: methods / rank | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: stats / rank | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: rlang / rank | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: dplyr / rank | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: stringr / rank | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: magrittr / rank | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: data.table / rank | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: janitor / rank | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: progress / rank | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: purrr / rank | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: tidyr / rank | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: forcats / rank | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: tibble / rank | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: plotly / rank | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: ggrepel / rank | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: grDevices / rank | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: curl / rank | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: readr / rank | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: httr / rank | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: R.utils / rank | |||||||||||||||
Property / cites work | |||||||||||||||
Property / cites work: Global analysis of protein structural changes in complex proteomes / rank | |||||||||||||||
Property / depends on software | |||||||||||||||
Property / depends on software: R / rank | |||||||||||||||
Property / software version identifier | |||||||||||||||
0.1.0 | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.1.0 / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.1.0 / qualifier | |||||||||||||||
publication date: 23 April 2021
| |||||||||||||||
Property / software version identifier | |||||||||||||||
0.1.1 | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.1.1 / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.1.1 / qualifier | |||||||||||||||
publication date: 10 May 2021
| |||||||||||||||
Property / software version identifier | |||||||||||||||
0.2.0 | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.2.0 / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.2.0 / qualifier | |||||||||||||||
publication date: 17 September 2021
| |||||||||||||||
Property / software version identifier | |||||||||||||||
0.2.1 | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.2.1 / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.2.1 / qualifier | |||||||||||||||
publication date: 11 January 2022
| |||||||||||||||
Property / software version identifier | |||||||||||||||
0.2.2 | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.2.2 / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.2.2 / qualifier | |||||||||||||||
publication date: 8 March 2022
| |||||||||||||||
Property / software version identifier | |||||||||||||||
0.3.0 | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.3.0 / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.3.0 / qualifier | |||||||||||||||
publication date: 12 April 2022
| |||||||||||||||
Property / software version identifier | |||||||||||||||
0.3.1 | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.3.1 / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.3.1 / qualifier | |||||||||||||||
publication date: 1 July 2022
| |||||||||||||||
Property / software version identifier | |||||||||||||||
0.4.0 | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.4.0 / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.4.0 / qualifier | |||||||||||||||
publication date: 8 September 2022
| |||||||||||||||
Property / software version identifier | |||||||||||||||
0.5.0 | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.5.0 / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.5.0 / qualifier | |||||||||||||||
publication date: 29 September 2022
| |||||||||||||||
Property / software version identifier | |||||||||||||||
0.7.0 | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.7.0 / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.7.0 / qualifier | |||||||||||||||
publication date: 17 February 2024
| |||||||||||||||
Property / last update | |||||||||||||||
17 February 2024
| |||||||||||||||
Property / last update: 17 February 2024 / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / description | |||||||||||||||
Useful functions and workflows for proteomics quality control and data analysis of both limited proteolysis-coupled mass spectrometry (LiP-MS) (Feng et. al. (2014) <doi:10.1038/nbt.2999>) and regular bottom-up proteomics experiments. Data generated with search tools such as 'Spectronaut', 'MaxQuant' and 'Proteome Discover' can be easily used due to flexibility of functions. | |||||||||||||||
Property / description: Useful functions and workflows for proteomics quality control and data analysis of both limited proteolysis-coupled mass spectrometry (LiP-MS) (Feng et. al. (2014) <doi:10.1038/nbt.2999>) and regular bottom-up proteomics experiments. Data generated with search tools such as 'Spectronaut', 'MaxQuant' and 'Proteome Discover' can be easily used due to flexibility of functions. / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / author | |||||||||||||||
Property / author: Jan-Philipp Quast / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / author | |||||||||||||||
Property / author: Dina Schuster / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / copyright license | |||||||||||||||
Property / copyright license: MIT license / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / copyright license | |||||||||||||||
Property / copyright license: File License / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / copyright license: File License / qualifier | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: rlang / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: dplyr / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: stringr / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: magrittr / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: data.table / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: janitor / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: progress / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: purrr / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: tidyr / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: ggplot2 / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: forcats / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: tibble / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: plotly / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: ggrepel / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: utils / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: grDevices / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: curl / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: readr / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: lifecycle / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: httr / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: methods / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: R.utils / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: stats / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / cites work | |||||||||||||||
Property / cites work: Global analysis of protein structural changes in complex proteomes / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / depends on software | |||||||||||||||
Property / depends on software: R / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / depends on software: R / qualifier | |||||||||||||||
software version identifier: ≥ 4.0 | |||||||||||||||
Property / MaRDI profile type | |||||||||||||||
Property / MaRDI profile type: MaRDI software profile / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
links / mardi / name | links / mardi / name | ||||||||||||||
Latest revision as of 19:56, 12 March 2024
Bottom-Up Proteomics and LiP-MS Quality Control and Data Analysis Tools
Language | Label | Description | Also known as |
---|---|---|---|
English | protti |
Bottom-Up Proteomics and LiP-MS Quality Control and Data Analysis Tools |
Statements
17 February 2024
0 references
Useful functions and workflows for proteomics quality control and data analysis of both limited proteolysis-coupled mass spectrometry (LiP-MS) (Feng et. al. (2014) <doi:10.1038/nbt.2999>) and regular bottom-up proteomics experiments. Data generated with search tools such as 'Spectronaut', 'MaxQuant' and 'Proteome Discover' can be easily used due to flexibility of functions.
0 references