AnanseSeurat (Q79450): Difference between revisions
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publication date: 11 November 2023
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11 November 2023
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Enables gene regulatory network (GRN) analysis on single cell clusters, using the GRN analysis software 'ANANSE', Xu et al.(2021) <doi:10.1093/nar/gkab598>. Export data from 'Seurat' objects, for GRN analysis by 'ANANSE' implemented in 'snakemake'. Finally, incorporate results for visualization and interpretation. | |||||||||||||||
| Property / description: Enables gene regulatory network (GRN) analysis on single cell clusters, using the GRN analysis software 'ANANSE', Xu et al.(2021) <doi:10.1093/nar/gkab598>. Export data from 'Seurat' objects, for GRN analysis by 'ANANSE' implemented in 'snakemake'. Finally, incorporate results for visualization and interpretation. / rank | |||||||||||||||
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Latest revision as of 18:55, 12 March 2024
Construct ANANSE GRN-Analysis Seurat
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | AnanseSeurat |
Construct ANANSE GRN-Analysis Seurat |
Statements
11 November 2023
0 references
Enables gene regulatory network (GRN) analysis on single cell clusters, using the GRN analysis software 'ANANSE', Xu et al.(2021) <doi:10.1093/nar/gkab598>. Export data from 'Seurat' objects, for GRN analysis by 'ANANSE' implemented in 'snakemake'. Finally, incorporate results for visualization and interpretation.
0 references
