pegas (Q20317): Difference between revisions
From MaRDI portal
Removed claim: copyright license (P163): GNU General Public License, version 2.0 (Q56623) |
Swh import (talk | contribs) SWHID from Software Heritage |
||||||||||||||
(12 intermediate revisions by 5 users not shown) | |||||||||||||||
Property / last update | |||||||||||||||
| |||||||||||||||
Property / last update: 23 February 2023 / rank | |||||||||||||||
Property / copyright license | |||||||||||||||
Property / copyright license: GNU General Public License, version 3.0 / rank | |||||||||||||||
Property / copyright license: GNU General Public License, version 3.0 / qualifier | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: graphics / rank | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: utils / rank | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: methods / rank | |||||||||||||||
Property / depends on software | |||||||||||||||
Property / depends on software: R / rank | |||||||||||||||
Property / depends on software | |||||||||||||||
Property / depends on software: ape / rank | |||||||||||||||
Property / software version identifier | |||||||||||||||
0.1 | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.1 / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.1 / qualifier | |||||||||||||||
publication date: 13 May 2009
| |||||||||||||||
Property / software version identifier | |||||||||||||||
0.2 | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.2 / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.2 / qualifier | |||||||||||||||
publication date: 7 October 2009
| |||||||||||||||
Property / software version identifier | |||||||||||||||
0.3-1 | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.3-1 / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.3-1 / qualifier | |||||||||||||||
publication date: 19 May 2010
| |||||||||||||||
Property / software version identifier | |||||||||||||||
0.3-2 | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.3-2 / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.3-2 / qualifier | |||||||||||||||
publication date: 10 June 2010
| |||||||||||||||
Property / software version identifier | |||||||||||||||
0.3-3 | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.3-3 / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.3-3 / qualifier | |||||||||||||||
publication date: 26 November 2010
| |||||||||||||||
Property / software version identifier | |||||||||||||||
0.3-4 | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.3-4 / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.3-4 / qualifier | |||||||||||||||
publication date: 1 April 2011
| |||||||||||||||
Property / software version identifier | |||||||||||||||
0.3 | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.3 / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.3 / qualifier | |||||||||||||||
publication date: 3 December 2009
| |||||||||||||||
Property / software version identifier | |||||||||||||||
0.4-1 | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.4-1 / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.4-1 / qualifier | |||||||||||||||
publication date: 19 January 2012
| |||||||||||||||
Property / software version identifier | |||||||||||||||
0.4-2 | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.4-2 / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.4-2 / qualifier | |||||||||||||||
publication date: 11 May 2012
| |||||||||||||||
Property / software version identifier | |||||||||||||||
0.4-3 | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.4-3 / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.4-3 / qualifier | |||||||||||||||
publication date: 31 July 2012
| |||||||||||||||
Property / software version identifier | |||||||||||||||
0.4-4 | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.4-4 / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.4-4 / qualifier | |||||||||||||||
publication date: 23 January 2013
| |||||||||||||||
Property / software version identifier | |||||||||||||||
0.4-5 | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.4-5 / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.4-5 / qualifier | |||||||||||||||
publication date: 6 June 2013
| |||||||||||||||
Property / software version identifier | |||||||||||||||
0.4 | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.4 / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.4 / qualifier | |||||||||||||||
publication date: 23 July 2011
| |||||||||||||||
Property / software version identifier | |||||||||||||||
0.5-1 | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.5-1 / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.5-1 / qualifier | |||||||||||||||
publication date: 10 January 2014
| |||||||||||||||
Property / software version identifier | |||||||||||||||
0.5 | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.5 / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.5 / qualifier | |||||||||||||||
publication date: 8 October 2013
| |||||||||||||||
Property / software version identifier | |||||||||||||||
0.6 | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.6 / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.6 / qualifier | |||||||||||||||
publication date: 21 August 2014
| |||||||||||||||
Property / software version identifier | |||||||||||||||
0.7 | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.7 / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.7 / qualifier | |||||||||||||||
publication date: 5 March 2015
| |||||||||||||||
Property / software version identifier | |||||||||||||||
0.8-1 | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.8-1 / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.8-1 / qualifier | |||||||||||||||
publication date: 24 June 2015
| |||||||||||||||
Property / software version identifier | |||||||||||||||
0.8-2 | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.8-2 / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.8-2 / qualifier | |||||||||||||||
publication date: 25 September 2015
| |||||||||||||||
Property / software version identifier | |||||||||||||||
0.8 | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.8 / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.8 / qualifier | |||||||||||||||
publication date: 20 May 2015
| |||||||||||||||
Property / software version identifier | |||||||||||||||
0.9 | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.9 / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.9 / qualifier | |||||||||||||||
publication date: 16 April 2016
| |||||||||||||||
Property / software version identifier | |||||||||||||||
0.10 | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.10 / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.10 / qualifier | |||||||||||||||
publication date: 3 May 2017
| |||||||||||||||
Property / software version identifier | |||||||||||||||
0.11 | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.11 / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.11 / qualifier | |||||||||||||||
publication date: 9 July 2018
| |||||||||||||||
Property / software version identifier | |||||||||||||||
0.12 | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.12 / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.12 / qualifier | |||||||||||||||
publication date: 5 October 2019
| |||||||||||||||
Property / software version identifier | |||||||||||||||
0.13 | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.13 / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.13 / qualifier | |||||||||||||||
publication date: 10 March 2020
| |||||||||||||||
Property / software version identifier | |||||||||||||||
0.14 | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.14 / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 0.14 / qualifier | |||||||||||||||
publication date: 16 September 2020
| |||||||||||||||
Property / software version identifier | |||||||||||||||
1.0-1 | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 1.0-1 / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 1.0-1 / qualifier | |||||||||||||||
publication date: 17 May 2021
| |||||||||||||||
Property / software version identifier | |||||||||||||||
1.0 | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 1.0 / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 1.0 / qualifier | |||||||||||||||
publication date: 8 April 2021
| |||||||||||||||
Property / software version identifier | |||||||||||||||
1.1 | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 1.1 / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 1.1 / qualifier | |||||||||||||||
publication date: 16 December 2021
| |||||||||||||||
Property / software version identifier | |||||||||||||||
1.3 | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 1.3 / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / software version identifier: 1.3 / qualifier | |||||||||||||||
publication date: 13 December 2023
| |||||||||||||||
Property / last update | |||||||||||||||
13 December 2023
| |||||||||||||||
Property / last update: 13 December 2023 / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / description | |||||||||||||||
Functions for reading, writing, plotting, analysing, and manipulating allelic and haplotypic data, including from VCF files, and for the analysis of population nucleotide sequences and micro-satellites including coalescent analyses, linkage disequilibrium, population structure (Fst, Amova) and equilibrium (HWE), haplotype networks, minimum spanning tree and network, and median-joining networks. | |||||||||||||||
Property / description: Functions for reading, writing, plotting, analysing, and manipulating allelic and haplotypic data, including from VCF files, and for the analysis of population nucleotide sequences and micro-satellites including coalescent analyses, linkage disequilibrium, population structure (Fst, Amova) and equilibrium (HWE), haplotype networks, minimum spanning tree and network, and median-joining networks. / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / author | |||||||||||||||
Property / author: Emmanuel Paradis / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / author | |||||||||||||||
Property / author: Thibaut Jombart / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / author | |||||||||||||||
Property / author: Zhian N. Kamvar / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / author | |||||||||||||||
Property / author: Brian J. Knaus / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / author | |||||||||||||||
Property / author: Klaus Schliep / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / author | |||||||||||||||
Property / author: Alastair J. Potts / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / author | |||||||||||||||
Property / author: David J. Winter / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / copyright license | |||||||||||||||
Property / copyright license: GNU General Public License, version 2.0 / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / copyright license | |||||||||||||||
Property / copyright license: GNU General Public License, version 3.0 / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / copyright license: GNU General Public License, version 3.0 / qualifier | |||||||||||||||
edition/version: expanded from: GPL (≥ 2) (English) | |||||||||||||||
Property / depends on software | |||||||||||||||
Property / depends on software: ape / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / depends on software: ape / qualifier | |||||||||||||||
software version identifier: ≥ 5.3-11 | |||||||||||||||
Property / depends on software | |||||||||||||||
Property / depends on software: R / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / depends on software: R / qualifier | |||||||||||||||
software version identifier: ≥ 3.2.0 | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: graphics / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: utils / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: methods / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / MaRDI profile type | |||||||||||||||
Property / MaRDI profile type: MaRDI software profile / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / source code repository | |||||||||||||||
Property / source code repository: https://github.com/cran/pegas / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / Software Heritage ID | |||||||||||||||
Property / Software Heritage ID: swh:1:snp:559c62f51b1f714a1c99250ebd15700ea54d0306 / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Property / Software Heritage ID: swh:1:snp:559c62f51b1f714a1c99250ebd15700ea54d0306 / qualifier | |||||||||||||||
Property / Software Heritage ID: swh:1:snp:559c62f51b1f714a1c99250ebd15700ea54d0306 / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 27 December 2023
| |||||||||||||||
links / mardi / name | links / mardi / name | ||||||||||||||
Latest revision as of 16:57, 21 March 2024
Population and Evolutionary Genetics Analysis System
Language | Label | Description | Also known as |
---|---|---|---|
English | pegas |
Population and Evolutionary Genetics Analysis System |
Statements
13 December 2023
0 references
Functions for reading, writing, plotting, analysing, and manipulating allelic and haplotypic data, including from VCF files, and for the analysis of population nucleotide sequences and micro-satellites including coalescent analyses, linkage disequilibrium, population structure (Fst, Amova) and equilibrium (HWE), haplotype networks, minimum spanning tree and network, and median-joining networks.
0 references
expanded from: GPL (≥ 2) (English)
0 references
27 December 2023
0 references