pcadapt (Q30217): Difference between revisions
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Property / last update: 5 May 2020 / rank | |||||||||||||||
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Property / cites work: pcadapt: an R package to perform genome scans for selection based on principal component analysis / rank | |||||||||||||||
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1.0 | |||||||||||||||
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publication date: 5 September 2015
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publication date: 9 November 2015
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2.0 | |||||||||||||||
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publication date: 4 November 2015
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publication date: 5 January 2016
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publication date: 18 December 2015
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publication date: 13 February 2016
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publication date: 14 June 2016
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publication date: 21 June 2016
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publication date: 3 November 2016
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publication date: 2 January 2017
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3.0 | |||||||||||||||
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publication date: 15 April 2016
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4.0.0 | |||||||||||||||
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publication date: 5 April 2018
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publication date: 13 April 2018
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4.0.3 | |||||||||||||||
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publication date: 3 July 2018
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4.1.0 | |||||||||||||||
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publication date: 27 February 2019
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4.3.1 | |||||||||||||||
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publication date: 28 February 2020
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4.3.5 | |||||||||||||||
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publication date: 29 August 2023
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Property / last update | |||||||||||||||
29 August 2023
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Property / last update: 29 August 2023 / rank | |||||||||||||||
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Property / description | |||||||||||||||
Methods to detect genetic markers involved in biological adaptation. 'pcadapt' provides statistical tools for outlier detection based on Principal Component Analysis. Implements the method described in (Luu, 2016) <doi:10.1111/1755-0998.12592> and later revised in (Privé, 2020) <doi:10.1093/molbev/msaa053>. | |||||||||||||||
Property / description: Methods to detect genetic markers involved in biological adaptation. 'pcadapt' provides statistical tools for outlier detection based on Principal Component Analysis. Implements the method described in (Luu, 2016) <doi:10.1111/1755-0998.12592> and later revised in (Privé, 2020) <doi:10.1093/molbev/msaa053>. / rank | |||||||||||||||
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Property / author | |||||||||||||||
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Property / author | |||||||||||||||
Property / author: Michael G. B. Blum / rank | |||||||||||||||
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Property / author | |||||||||||||||
Property / author: Florian Privé / rank | |||||||||||||||
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Property / copyright license | |||||||||||||||
Property / copyright license: GNU General Public License, version 2.0 / rank | |||||||||||||||
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Property / copyright license | |||||||||||||||
Property / copyright license: GNU General Public License, version 3.0 / rank | |||||||||||||||
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Property / copyright license: GNU General Public License, version 3.0 / qualifier | |||||||||||||||
edition/version: expanded from: GPL (≥ 2) (English) | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
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software version identifier: ≥ 0.12.8 | |||||||||||||||
Property / imports | |||||||||||||||
Property / imports: RSpectra / rank | |||||||||||||||
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Property / cites work | |||||||||||||||
Property / cites work: pcadapt: an R package to perform genome scans for selection based on principal component analysis / rank | |||||||||||||||
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Property / cites work | |||||||||||||||
Property / cites work: Performing Highly Efficient Genome Scans for Local Adaptation with R Package pcadapt Version 4 / rank | |||||||||||||||
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Property / source code repository | |||||||||||||||
Property / source code repository: https://github.com/cran/pcadapt / rank | |||||||||||||||
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Property / Software Heritage ID | |||||||||||||||
Property / Software Heritage ID: swh:1:snp:38c52ee560ef989e438ffa0aeede1bdf38fa407d / rank | |||||||||||||||
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Property / Software Heritage ID: swh:1:snp:38c52ee560ef989e438ffa0aeede1bdf38fa407d / qualifier | |||||||||||||||
Property / Software Heritage ID: swh:1:snp:38c52ee560ef989e438ffa0aeede1bdf38fa407d / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 31 August 2023
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links / mardi / name | links / mardi / name | ||||||||||||||
Latest revision as of 19:25, 21 March 2024
Fast Principal Component Analysis for Outlier Detection
Language | Label | Description | Also known as |
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English | pcadapt |
Fast Principal Component Analysis for Outlier Detection |
Statements
29 August 2023
0 references
Methods to detect genetic markers involved in biological adaptation. 'pcadapt' provides statistical tools for outlier detection based on Principal Component Analysis. Implements the method described in (Luu, 2016) <doi:10.1111/1755-0998.12592> and later revised in (Privé, 2020) <doi:10.1093/molbev/msaa053>.
0 references
expanded from: GPL (≥ 2) (English)
0 references